7 мая 1876 г. Указом императора Александра II были образованы мореходные классы Санкт-Петербургского речного яхт-клуба, положившие начало крупнейшему в мире научному и учебному центру по подготовке специалистов для морского флота России.
6 мая 1902 г. Император Николай II учредил на базе мореходных классов училище дальнего плавания. В связи с 200-летием основания Санкт-Петербурга училищу было присвоено имя императора Петра Первого.
13 июня 1905 г. училище дальнего плавания было реорганизовано в Санкт-Петербургские соединенные училища дальнего плавания и судовых механиков торгового флота Императора Петра Первого.
В феврале 1919 г. Верховная коллегия Главвода приняла решение о преобразовании соединенных училищ в Петроградский техникум водных сообщений, который с 26 января 1924 г. стал называться Ленинградским морским техникумом.
В 1935 г образован Гидрографический институт Главсевморпути.
В 1944 г. - подписано Постановление Государственного Совета Обороны об образовании Ленинградского высшего мореходного училища, а в 1945 г. на базе Гидрографического института образовано Высшее арктическое морское училище, которому в 1949 г. присвоено имя прославленного русского адмирала С.О. Макарова В 1954 г. эти учебные заведения были объединены и преобразованы в Ленинградское высшее инженерное морское училище им. адм. С. О. Макарова. (ЛВИМУ). В декабре 1990 г. ЛВИМУ им. адм. С. О. Макарова получило статус Академии.
На протяжении всей истории в академии работали видные ученые и известные моряки: Шокальский Ю. М. - русский ученый-океанограф, географ и картограф, Шершов А. П. - ученый кораблестроитель, профессора: Н. Н. Матусевич, Б. П. Хлюстин, К. С. Ухов, А. П. Ющенко, Н. Ю. Рыбалтовский,
Д. Б. Танатар, Г. С. Максимов, В. Н. Кедроливанский, Б. И. Кудревич, Е. Я. Щеголев, капитаны дальнего плавания доценты: Н. М. Николаев, Г.М. Алексеев.